Microsoft basó su querella contra Lindows en el supuesto de que ésta incurría en una violación de sus derechos de propiedad intelectual sobre la marca registrada Windows. La argumentación del gigante informático fue que el nombre Lindows crearía desorientación entre los usuarios, quienes experimentarían problemas prácticos con sus programas debido a la confusión de nombres. De igual modo, Microsoft explicó mediante sus abogados que el código de sistema Lindows destacaba por su gran cantidad de errores.
El juez instructor John C. Coughenour no pudo dejar pasar este último argumento, señalando que Microsoft debería quizás abstenerse de criticar programas que contienen errores al momento de su lanzamiento. Luego, concluyó lacónico que rechazaba el requerimiento de Microsoft en contra de Lindows.
El juez también recordó que Microsoft nunca ha reaccionado contra compañías que usan total o parcialmente el nombre de Windows en sus productos, a la vez que observó que Microsoft no debería arrogarse una propiedad absoluta de la palabra “Windows”. Sin duda alguna, esta última observación, al venir de un juez, podría perjudicar a futuro a Microsoft, con lo que el requerimiento contra Lindows podría ser contraproducente en grado máximo.
Cuando Microsoft intentó patentar la marca registrada Windows en 1990, su solicitud fue rechazada en varias ocasiones, debido a que la palabra era demasiado general como para ser protegida legalmente.
Microsoft anunció que estudiaría la posibilidad de apelar al fallo del juez Coughenour. La compañía está involucrada en una serie de juicios, y sólo el trimestre pasado destinó 600 millones de dólares para gastos de abogados y posibles indemnizaciones.
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