El IntelliMouse Explorer se basa en una tecnología de lectura denominada IntelliEye, que funciona en base a un sensor óptico que capta 1500 imágenes por segundo de la superficie en que se desplaza el ratón. Las imágenes son analizadas por un procesador digital de señal (DSP por sus iniciales en inglés), que las interpreta como movimientos que el cursor debe seguir.
IntelliMouse funciona en todas las superficies excepto el vidrio, siendo su gran ventaja que no contiene piezas móviles que tarde o temprano se estropean.