Lo anterior se debe a que el código definitivo de Windows 2000 sólo estuvo disponible para desarrolladores y productores de software el día 15 de diciembre, siendo posible sólo entonces comenzar con el proceso de certificación. Microsoft también somete al software de terceros a un intenso proceso de pruebas antes de certificar su compatibilidad con Windows 2000, evitando de esa forma futuros problemas al usuario.
Con todo, Microsoft observa que la mayoría de los antiguos programas para Windows NT funcionarán sin problemas bajo la nueva plataforma Windows 2000, pero que al incluirse el logotipo del nuevo sistema operativo en los paquetes de software de terceros se busca garantizar la compatibilidad total y, con ello, la estabilidad del sistema.
